Phát triển phần mềm tìm vi khuẩn kháng thuốc

Các nhà nghiên cứu ĐH bang Washington vừa phát triển một chương trình phần mềm dễ sử dụng để xác định các gien kháng thuốc ở vi khuẩn.

Các nhà nghiên cứu ĐH bang Washington vừa phát triển một chương trình phần mềm dễ sử dụng để xác định các gien kháng thuốc ở vi khuẩn.

Chương trình có thể giúp dễ dàng xác định vi khuẩn kháng kháng sinh gây chết người tồn tại trong môi trường. Những vi khuẩn như vậy hàng năm gây ra hơn 2,8 triệu bệnh viêm phổi khó điều trị, nhiễm trùng máu, các bệnh nhiễm trùng khác và 35.000 ca tử vong ở Hoa Kỳ.

Kháng kháng sinh (AMR) xảy ra khi vi khuẩn hoặc các vi sinh vật khác tiến hóa hoặc có được các gien mã hóa các cơ chế kháng thuốc. Vi khuẩn gây nhiễm trùng tụ cầu khuẩn hoặc các bệnh như lao, viêm phổi đã phát triển các chủng kháng thuốc khiến chúng ngày càng khó điều trị và đôi khi không thể điều trị.

Abu Sayed Chowdhury- tác giả chính cho biết: “Chúng ta cần phát triển các công cụ để dự đoán dễ dàng và hiệu quả khả năng chống kháng vi khuẩn đang ngày càng đe dọa sức khỏe và sinh kế trên toàn thế giới”.

Nhóm nghiên cứu đã phát triển một thuật toán học máy sử dụng các tính năng của protein AMR thay vì sự giống nhau của trình tự gien để xác định gien AMR. Theo đó, họ đã xem xét sự tương tác một số tính năng của vật liệu di truyền, bao gồm cấu trúc, tính chất hóa lý và thành phần của các chuỗi protein chứ không chỉ đơn giản là tương tự về trình tự.

“Phần mềm của chúng tôi có thể được sử dụng để phân tích dữ liệu di truyền lớn sâu hơn mức có thể đạt được bằng các thuật toán khớp chuỗi đơn giản. Đây có thể là một công cụ quan trọng để xác định các gien kháng kháng khuẩn mới có thể quan trọng về mặt lâm sàng”- Chowdhury nói.

HẢI HUỲNH

(Nguồn: the journal Scientific Reports)